關於保存方式，是許多人在購買手工餅乾禮盒前最常詢問的問題之一。一般來說，手工餅乾的保存期限會依原料與製作方式而有所不同，但多半落在 2 週至 2 個月之間。

大多數手工餅乾禮盒在未開封狀態下，只要放置於陰涼乾燥處即可，不需要冷藏。反而冷藏容易產生水氣，影響餅乾口感，造成受潮變軟。

開封後建議儘快食用，並將餅乾密封保存，避免接觸空氣與濕氣。若禮盒內含巧克力或夾心餅乾，則可依店家建議適度冷藏，但食用前記得回溫，口感會更好。

選擇手工餅乾禮盒時，也可以留意是否有清楚標示保存期限與方式，這通常也是專業品牌的重要指標之一。